燃料电池物流车具备高载重、长续航和加氢快等优势，适用于城市支干线运输和城际运输场景。在环保日益严格情况下，传统中重卡面临路权问题，燃料电池物流车是其最佳替代者。纯电动物流车具备使用成本低优势，但是因为能量密度低，续航和载重难以兼具，而且面临充电时间长问题，目前适合于短途运输场景。
在全生命周期相同的运营里程下，比较燃料电池物流车、纯电动物流车和燃油物流车三者的全生命周期成本，燃料电池物流车在当前补贴基础下经济性优于燃油物流车；纯电动物流车在低负载短途运输场景下经济性明显。在地补为国补0.6倍情况下，燃料电池汽车全生命周期使用成本为1.67元/km和同级燃油物流车使用成本持平；在上海、武汉和深圳等地区，地补与国补可以达到1比1，燃料电池物流车经济性显著优于燃油物流车。考虑燃料电池物流车仅仅数百台级规模，未来伴随氢气价格和燃料电池成本下降经济性将愈加明显。
中长期角度来看，通过对纯电动物流车和燃料电池物流车降本进行敏感性分析，并且考虑补贴退坡，我们可以发现燃料电池物流车全生命周期经济性愈发明显；纯电动物流车在低负载领域具备经济性，载重提升后经济性缩小：
纯电动物流车随着成本下降可应对补贴退坡，在2021年纯电动物流车完全没有补贴，经济性依然优于燃油物流车，但载重提升后经济性缩小。
2020年，燃料电池补贴不退坡，按照地补为国补的0.6倍情况下，燃料电池系统成本下降50%，整车成本下降35%，氢气价格下降到30元/kg，燃料电池物流车全生命周期成本19.55万，每公里成本0.54元/km，相对于燃油物流车成本低67%。
2025年，燃料电池地补完全退坡，燃料电池系统成本下降90%，整车成本下降62%，氢气价格下降到28元/kg，燃料电池物流车全生命周期成本23.45万，每公里成本0.65元/km，相对燃油物流车成本低61%。
从物流配送企业角度出发，燃料电池物流车综合场景下吨利润最高。物流配送企业单车运营收入与载重、里程呈正相关；单车运营成本包括燃料成本、司机成本和租金成本等。在非限行区域，燃料电池物流车、燃油车和电动物流车运输每吨货物利润分别为 73.6/74.3/56.7元；在限行区域，燃料电池物流车、燃油车和电动物流车每吨运输利润分别为71.9/66.4/51.2元。综合场景考虑燃料电池物流车吨利润最高；纯电动物流车虽然燃料成本低，但是加上司机和租金成本后，吨利润反而最低。
